Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAP2EQ6VUC0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAP2EQ6VUC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms