Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP12Q6UXS9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms