Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNT2Q6UVM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT2Q6UVM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT2Q6UVM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT2Q6UVM3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms