Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RWDD4Q6NW29 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RWDD4Q6NW29 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RWDD4Q6NW29 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RWDD4Q6NW29 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms