Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGB2Q6NT52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGB2Q6NT52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms