Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO4Q6EEV6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO4Q6EEV6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms