Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DUPD1Q68J44 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms