Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ALS2CLQ60I27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALS2CLQ60I27 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALS2CLQ60I27 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms