Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DENND4CQ5VZ89 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND4CQ5VZ89 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DENND4CQ5VZ89 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms