Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF18Q5VWM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRAMEF18Q5VWM3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAMEF18Q5VWM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms