Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRCH2Q5VUJ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRCH2Q5VUJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRCH2Q5VUJ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms