Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF20Q5VTR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF20Q5VTR2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF20Q5VTR2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF20Q5VTR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms