Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZC3H13Q5T200 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ZC3H13Q5T200 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ZC3H13Q5T200 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZC3H13Q5T200 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ZC3H13Q5T200 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms