Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM201Q5SNT2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM201Q5SNT2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM201Q5SNT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms