Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PPM1JQ5JR12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1JQ5JR12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1JQ5JR12 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1JQ5JR12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms