Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB2Q5IJ48 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB2Q5IJ48 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB2Q5IJ48 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms