Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3AQ59EK9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms