Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CDCA8Q53HL2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CDCA8Q53HL2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDCA8Q53HL2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDCA8Q53HL2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms