Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO43Q4G163 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO43Q4G163 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO43Q4G163 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms