Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC153Q494R4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC153Q494R4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC153Q494R4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms