Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRIT3Q3SXY7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIT3Q3SXY7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRIT3Q3SXY7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRIT3Q3SXY7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms