Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI70

KRTAP19-6, Keratin-associated protein 19-6, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-6Q3LI70 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP19-6Q3LI70 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP19-6Q3LI70 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms