Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM249Q2WGJ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM249Q2WGJ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM249Q2WGJ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms