Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTC4SQ16873 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTC4SQ16873 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTC4SQ16873 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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