Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR2Q16832 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR2Q16832 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR2Q16832 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR2Q16832 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDR2Q16832 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDR2Q16832 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDR2Q16832 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDR2Q16832 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDR2Q16832 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms