Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATP2B3Q16720 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B3Q16720 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B3Q16720 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B3Q16720 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B3Q16720 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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