Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NREPQ16612 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NREPQ16612 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NREPQ16612 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NREPQ16612 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NREPQ16612 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NREPQ16612 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NREPQ16612 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NREPQ16612 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NREPQ16612 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NREPQ16612 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NREPQ16612 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NREPQ16612 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NREPQ16612 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NREPQ16612 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NREPQ16612 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NREPQ16612 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NREPQ16612 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NREPQ16612 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NREPQ16612 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NREPQ16612 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NREPQ16612 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NREPQ16612 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NREPQ16612 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NREPQ16612 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NREPQ16612 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NREPQ16612 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NREPQ16612 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NREPQ16612 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NREPQ16612 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NREPQ16612 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NREPQ16612 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NREPQ16612 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NREPQ16612 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NREPQ16612 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NREPQ16612 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NREPQ16612 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NREPQ16612 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NREPQ16612 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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