Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARTPTQ16568 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARTPTQ16568 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARTPTQ16568 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARTPTQ16568 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARTPTQ16568 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARTPTQ16568 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARTPTQ16568 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARTPTQ16568 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARTPTQ16568 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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