Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNRNP35Q16560 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNRNP35Q16560 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNRNP35Q16560 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP35Q16560 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRNP35Q16560 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms