Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP2Q16527 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRP2Q16527 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRP2Q16527 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRP2Q16527 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms