Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VPS72Q15906 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
VPS72Q15906 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
VPS72Q15906 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VPS72Q15906 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms