Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA6Q15825 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA6Q15825 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA6Q15825 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA6Q15825 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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