Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA2Q15560 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TCEA2Q15560 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCEA2Q15560 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCEA2Q15560 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms