Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHHQ15465 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHHQ15465 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHHQ15465 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHHQ15465 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHHQ15465 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHHQ15465 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHHQ15465 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHHQ15465 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHHQ15465 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHHQ15465 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHHQ15465 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHHQ15465 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SHHQ15465 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHHQ15465 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHHQ15465 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHHQ15465 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHHQ15465 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHHQ15465 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHHQ15465 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHHQ15465 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHHQ15465 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHHQ15465 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHHQ15465 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHHQ15465 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHHQ15465 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHHQ15465 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHHQ15465 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHHQ15465 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHHQ15465 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHHQ15465 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHHQ15465 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SHHQ15465 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHHQ15465 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHHQ15465 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHHQ15465 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHHQ15465 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHHQ15465 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHHQ15465 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHHQ15465 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHHQ15465 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHHQ15465 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHHQ15465 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHHQ15465 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHHQ15465 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHHQ15465 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHHQ15465 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHHQ15465 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHHQ15465 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHHQ15465 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHHQ15465 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHHQ15465 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHHQ15465 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHHQ15465 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHHQ15465 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHHQ15465 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHHQ15465 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHHQ15465 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHHQ15465 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHHQ15465 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHHQ15465 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHHQ15465 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHHQ15465 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SHHQ15465 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHHQ15465 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SHHQ15465 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHHQ15465 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHHQ15465 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHHQ15465 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHHQ15465 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHHQ15465 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHHQ15465 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHHQ15465 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHHQ15465 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
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