Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCP1Q15431 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP1Q15431 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP1Q15431 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
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