Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCM1Q15154 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCM1Q15154 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCM1Q15154 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms