Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF1Q14990 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF1Q14990 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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