Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO1Q147U7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMCO1Q147U7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMCO1Q147U7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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