Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD9Q14511 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD9Q14511 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD9Q14511 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD9Q14511 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD9Q14511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD9Q14511 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD9Q14511 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD9Q14511 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD9Q14511 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD9Q14511 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEDD9Q14511 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD9Q14511 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEDD9Q14511 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEDD9Q14511 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD9Q14511 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD9Q14511 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEDD9Q14511 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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