Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERV3-1Q14264 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERV3-1Q14264 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERV3-1Q14264 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms