Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFR3AQ14156 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFR3AQ14156 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFR3AQ14156 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms