Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIRBPQ14011 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CIRBPQ14011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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