Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRR1Q13601 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRR1Q13601 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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