Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PKD2Q13563 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PKD2Q13563 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PKD2Q13563 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PKD2Q13563 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PKD2Q13563 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
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