Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC3Q13507 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRPC3Q13507 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC3Q13507 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
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