Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SF3B2Q13435 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SF3B2Q13435 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SF3B2Q13435 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SF3B2Q13435 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
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