Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STRN3Q13033 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRN3Q13033 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRN3Q13033 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRN3Q13033 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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