Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMARCB1Q12824 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCB1Q12824 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMARCB1Q12824 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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