Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD3Q0VAK6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
LMOD3Q0VAK6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LMOD3Q0VAK6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms