Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP1Q09161 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP1Q09161 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NCBP1Q09161 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NCBP1Q09161 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms